Në këtë punim, prezantohen dy aminoacide bazë, glicina (Gly) dhe alanina (Ala).Kjo është kryesisht sepse ato mund të veprojnë si aminoacide bazë dhe shtimi i grupeve në to mund të gjenerojë lloje të tjera të aminoacideve.
Glicina ka një shije të veçantë të ëmbël, kështu që emri i saj në anglisht vjen nga greqishtja glykys (e ëmbël).Përkthimi kinez i glicinës jo vetëm që ka kuptimin "e ëmbël", por ka edhe shqiptim të ngjashëm, i cili mund të quhet modeli i "besnikërisë, arritjes dhe elegancës".Për shkak të shijes së saj të ëmbël, glicina përdoret shpesh si një agjent aromatizues në industrinë ushqimore për të hequr hidhërimin dhe për të rritur ëmbëlsinë.Zinxhiri anësor i glicinës është i vogël me vetëm një atom hidrogjeni.Kjo e bën atë të ndryshëm.Është një aminoacid bazë pa kiralitet.
Glicina në proteina karakterizohet nga madhësia dhe fleksibiliteti i saj i vogël.Për shembull, konformimi i heliksit me tre fije të kolagjenit është shumë i veçantë.Duhet të ketë një glicinë për çdo dy mbetje, përndryshe do të shkaktojë shumë pengesa sterike.Në mënyrë të ngjashme, lidhja midis dy fushave të një proteine shpesh kërkon që glicina të sigurojë fleksibilitet konformues.Megjithatë, nëse glicina është mjaft fleksibël, stabiliteti i saj është domosdoshmërisht i pamjaftueshëm.
Glicina është një nga prishësit gjatë formimit të α-spiralës.Arsyeja është se zinxhirët anësor janë shumë të vegjël për të stabilizuar fare konformacionin.Përveç kësaj, glicina përdoret shpesh për të përgatitur zgjidhje tampon.Ata prej jush që bëjnë elektroforezë shpesh e kujtojnë këtë.
Emri në anglisht i alaninës vjen nga acetaldehidi gjerman, dhe emri kinez është më i lehtë për t'u kuptuar sepse alanina përmban tre karbone dhe emri i tij kimik është alaninë.Ky është një emër i thjeshtë, siç është karakteri i aminoacidit.Zinxhiri anësor i alaninës ka vetëm një grup metil dhe është pak më i madh se ai i glicinës.Kur vizatova formulat strukturore për 18 aminoacidet e tjera, i shtova grupe alaninës.Në proteina, alanina është si një tullë, një material themelor i zakonshëm ndërtimi që nuk bie ndesh me askënd.
Zinxhiri anësor i alaninës ka pak pengesë dhe ndodhet në heliksin α, që është një konformacion.Është gjithashtu shumë i qëndrueshëm kur paloset β.Në inxhinierinë e proteinave, nëse doni të ndryshoni një aminoacid pa një objektiv specifik në një proteinë, në përgjithësi mund ta ndryshoni atë në alaninë, gjë që nuk është e lehtë të shkatërrohet konformacioni i përgjithshëm i proteinës.
Koha e postimit: Maj-29-2023