Peptidet depërtuese të qelizave janë peptide të vogla që mund të depërtojnë lehtësisht në membranën qelizore.Kjo klasë molekulash, veçanërisht CPP-të me funksione të shënjestruar, premton për shpërndarje efikase të barnave në qelizat e synuara.
Prandaj, hulumtimi mbi të ka një rëndësi të caktuar biomjekësore.Në këtë studim, CPP-të me aktivitete të ndryshme transmembranore u studiuan në nivel sekuence, duke u përpjekur të zbulojnë faktorët që ndikojnë në aktivitetin transmembranor të CPP-ve, ndryshimet e sekuencës midis CPP-ve me aktivitete të ndryshme dhe joCPP-ve dhe të prezantojnë një metodë për analizimin e sekuencave biologjike.
Sekuencat CPP dhe NonCPP u morën nga baza e të dhënave CPPsite dhe literaturë të ndryshme, dhe peptidet transmembranore (HCPPs, MCPPs, LCPPs) me aktivitet transmembranor të lartë, të mesëm dhe të ulët u nxorën nga sekuencat CPPs për të ndërtuar grupe të dhënash.Bazuar në këto grupe të dhënash, u kryen studimet e mëposhtme:
1, Përbërja e aminoacideve dhe strukturave dytësore të CPP-ve të ndryshme aktive dhe joCPP-ve u analizuan me ANOVA.U zbulua se ndërveprimet elektrostatike dhe hidrofobike të aminoacideve luajtën një rol të rëndësishëm në aktivitetin transmembranor të CPP-ve, dhe struktura spirale dhe mbështjellja e rastësishme ndikuan gjithashtu në aktivitetin transmembranor të CPP-ve.
2. Vetitë fizike dhe kimike dhe gjatësitë e CPP-ve me aktivitete të ndryshme u shfaqën në planin dydimensional.U konstatua se CPP-të dhe JoCPP-të me aktivitete të ndryshme mund të grumbulloheshin nën disa veti të veçanta, dhe HCPP-të, MCPP-të, LCPP-të dhe JoCPP-të u ndanë në tre grupime, duke treguar dallimet e tyre;
3. Në këtë punim prezantohet koncepti i centroidit fizik dhe kimik të sekuencës biologjike, dhe mbetjet që përbëjnë sekuencën konsiderohen si pika grimcash dhe sekuenca abstragohet si një sistem grimcash për kërkime.Kjo metodë u aplikua në analizën e CPP-ve duke projektuar CPP me aktivitete të ndryshme në planin 3D me metodën PCA, dhe u zbulua se shumica e CPP-ve u grumbulluan së bashku dhe disa LCPP u grumbulluan së bashku me jo-CPP.
Ky studim ka implikime për hartimin e CPP-ve dhe kuptimin e dallimeve në sekuencat e CPP-ve me aktivitete të ndryshme.Gjithashtu, metoda e analizës së centroidit fizik dhe kimik të sekuencave biologjike e prezantuar në këtë punim mund të përdoret edhe për analizën e problemeve të tjera biologjike.Në të njëjtën kohë, ato mund të përdoren si parametra hyrës për disa probleme të klasifikimit biologjik dhe të luajnë një rol në njohjen e modelit.
Koha e postimit: Qershor-15-2023